MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-3

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017427	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017427	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017427	AGG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017427	TA	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017427	CTA	2	6	17243	17248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017427	ATA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017427	TAA	3	9	17325	17333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017427	A	7	7	17332	17338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017427	TAG	2	6	17799	17804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017427	TAA	2	6	18802	18807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017427	TA	3	6	18813	18818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017427	T	6	6	18840	18845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017427	A	6	6	18848	18853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017427	A	6	6	18859	18864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017427	TAT	3	9	18919	18927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017427	ATA	2	6	18965	18970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017427	TTAAA	2	10	19008	19017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017427	T	7	7	19046	19052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017427	TAA	2	6	19071	19076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017427	T	7	7	19090	19096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017427	TACT	2	8	19137	19144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017427	TAA	2	6	21571	21576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017427	T	6	6	22773	22778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017427	TGA	2	6	22799	22804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017427	TAT	2	6	22809	22814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017427	T	6	6	22863	22868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017427	TTTTA	2	10	22892	22901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017427	ACAAAT	2	12	22902	22913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017427	AT	3	6	22935	22940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017427	ATT	2	6	22944	22949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017427	ATT	2	6	22965	22970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017427	TAA	2	6	22972	22977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017427	TTA	2	6	23001	23006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017427	AAT	2	6	23008	23013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017427	AT	4	8	23051	23058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017427	A	6	6	23073	23078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017427	CAATC	2	10	23096	23105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017427	TAAA	2	8	23142	23149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017427	T	7	7	23158	23164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017427	T	6	6	23171	23176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017427	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017427	TA	3	6	23206	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017427	TTAT	2	8	23213	23220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017427	A	6	6	24582	24587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017427	A	7	7	24590	24596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017427	AGG	2	6	24609	24614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017427	ATTA	2	8	24615	24622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017427	GTT	2	6	25848	25853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017427	AAGTAA	2	12	25865	25876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017427	A	6	6	25888	25893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017427	TGCA	2	8	25951	25958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017427	AGG	2	6	25972	25977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017427	TAA	2	6	25982	25987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017427	AGT	2	6	25993	25998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017427	GGT	2	6	26009	26014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017427	AAGA	2	8	26019	26026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017427	AT	3	6	26043	26048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017427	AATTT	2	10	26063	26072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017427	TA	3	6	26190	26195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017427	TATT	2	8	26216	26223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017427	GAA	2	6	26966	26971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017427	TAA	2	6	26978	26983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017427	T	7	7	26993	26999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017427	TTTA	2	8	27056	27063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017427	TA	3	6	27062	27067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017427	CT	3	6	27068	27073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017427	TAA	2	6	27659	27664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017427	AATA	2	8	27670	27677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017427	ATA	2	6	27707	27712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017427	GTT	2	6	27759	27764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.